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Ausschreibender Bereich: IBG-1 - Biotechnologie
Kennziffer: 2020M-006, Biologie, Biochemie, Biotechnologie, Mikrobiologie

Masterarbeit: Virus-Wirt-Interaktion in biotechnologisch-relevanten Bakterien

Über uns
Mit fast 6000 Mitarbeitern zählt das Forschungszentrum Jülich zu einem der größten Forschungszentren Europas. Das Institut für Bio- und Geowissenschaften (IBG-1: Biotechnologie) fokussiert sich auf die molekulare und angewandte Mikrobiologie. Die ausgeschriebene Masterstelle bietet die Möglichkeit an einem ERC geförderten Projekt (ERC starting grant “Pro_Phage”) mitzuarbeiten und Teil unserer Helmholtz Forschungsgruppe zu sein. Gegenwärtige Projekte unserer Arbeitsgruppe befassen sich mit der regulatorischen Interaktion von (Pro-)Phagen und ihrem Wirt sowie mit der Erforschung von neuartigen anti-viralen Abwehrmechanismen.

Projekt und Methodik

Viren repräsentieren die abundanteste biologische Entität dieses Planeten und prägen somit das Leben in allen Ökosystemen. Bakterien und Viren(Phagen) befinden sich seit Milliarden von Jahren in einem molekularen Wettrüsten, welches auf Seite der Phagen ständig neue Angriffsstrategien hervorbringt, was wiederrum zu neuen Verteidigungsmaßnahmen auf Seiten der Bakterien führt. Die bekanntesten Abwehrmechanismen gegen Phagen sind Restriktionsmodifikationssysteme, die CRISPR-Cas-Immunität und Mechanismen abortiver Infektionen. Während man lange Zeit davon ausging, dass diese Systeme das volle Ausmaß der bakteriellen Abwehrmaßnahmen repräsentieren, haben jüngste Arbeiten einen viel größeren und vielfältigeren Satz von mutmaßlichen Verteidigungsstrategien aufgedeckt, deren Mechanismen weitgehend unbekannt sind.

Wir suchen daher zum nächst möglichen Zeitpunkt eine/n Masterstudenten/in für die Untersuchung neuer antiviraler Abwehrstrategien in Bakterien. In Ihrer Arbeit untersuchen Sie bakterielle Kontrollmechanismen zur Produktion und Freisetzung antiviraler Substanzen während einer Phageninfektion und ihre Wirkung auf den viralen Lebenszyklus. Dabei kommen klassische und innovative molekulare, genetische und biochemische Methoden (Proteinreinigung und Protein-DNA Interaktionsstudien), Kultivierung von Bakterienstämmen in unterschiedlichen Maßstäben (Mikrotiterplatten, Schüttelkolben, 1LBioreaktor) sowie Next-Generation Sequencing (z.B. NGS, RNA-Seq and ChIP-Seq), Live Cell Imaging und Durchflusszytometrie (FACS) zum Einsatz.

Ihr Profil:
Wir freuen uns auf Studenten (w/m/d) der Biologie, Biochemie, Biotechnologie, Mikrobiologie oder verwandter Felder. Nach der Einarbeitung sollten Sie in der Lage sein, selbständig und sorgfältig an dem Projekt zu arbeiten. Ebenso erwartet werden soziale Kompetenz, Effizienz und Freude an Teamarbeit. Bewerbungen von Personen mit Behinderung sind willkommen.
Bewerbungen (Unterlagen inkl. Anschreiben, CV, Zeugnisse bzw. aktueller Notenspiegel) richten Sie bitte per E-Mail an Prof. Dr. Julia Frunzke.

Ansprechpartner und Informationen
Prof. Dr. Julia Frunzke
Forschungszentrum Jülich GmbH
Institut für Bio- und Geowissenschaften
52425 Jülich

Tel: 02461- 61-5430; Fax: 02461- 61-2710
E-Mail: j.frunzke@fz-juelich.de
http://www.fz-juelich.de/ibg/ibg-1/EN/Research/SystemicMicrobiology/population/population_node.html

Ausschreibung als pdf-Datei:  Masterarbeit: Virus-Wirt-Interaktion in biotechnologisch-relevanten Bakterien (PDF, 595 kB)